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dotnet run では動くのに dotnet publish 後に失敗するケースです。原因はランタイムではなく発行フォルダーに DLL がないことです。deps.json、ProjectReference の Private、トリミングを確認してください。

Native AOT は JIT とインタープリターを取り除くため、reflection emit、式ツリーのコンパイル、未知の MakeGenericType は実行時に例外を投げます。IL3050 で呼び出しを特定し、ソースジェネレーターまたは事前生成された経路に置き換えます。