Solución: la UI de Flutter se superpone a la barra de navegación del sistema Android al apuntar al SDK 35
Apuntar al SDK 35 de Android pone tu app Flutter en modo edge-to-edge, así que el cuerpo del Scaffold se dibuja detrás de la barra de navegación. Consume los insets con SafeArea y el padding de MediaQuery en lugar de desactivarlo, porque esa exclusión ya está muerta en Android 16.